论文部分内容阅读
为了研究黄淮山羊多胎性状和遗传多样性,开发利用我国地方品种资源以及保护山羊物种多样性,同时为黄淮山羊的品种选育及产业化开发提供依据。本研究克隆BMP-4基因全长编码序列、内含子及启动子,在E.coli中诱导表达成熟肽并对诱导条件进行优化,同时用RT-PCR的方法检测其在黄淮山羊7种组织中的表达含量。通过研究得到如下结论:1结合NCBI数据库已登陆的其他物种BMP-4基因的序列,采用分段扩增的方法,从黄淮山羊的肾组织中克隆到一条长1230bp的完整阅读框(ORF)cDNA序列。本序列已提交NCBI,登录号为:EF632080。对所得到的编码序列进行同源性分析,山羊与绵羊、猪、人、小鼠和牛的相应序列同源性分别为:99.43%、96.10%、94.96%、91.79%、99.19%;表明此基因在各物种间高度保守。其中,与人和小鼠的BMP-4相比,山羊BMP-4编码序列多三个碱基,而山羊与绵羊、牛相应序列的同源性达到了99%以上,暗示山羊和绵羊、牛亲缘关系较其他物种更近。黄淮山羊BMP-4基因全编码序列编码409个氨基酸,其前19个氨基酸为信号肽,后116个氨基酸为成熟肽,中间的274个氨基酸为前肽,蛋白的理论分子量为46.63kDa。氨基酸成熟蛋白区具有BMPs家族的典型特征:七个半胱氨酸残基。与绵羊、猪、人、小鼠和牛的同源性分别为:99.51%、98.53%、97.80%、98.04%、99.51%,这些也说明BMP-4基因是一种在进化上很保守的蛋白质。2通过PCR方法克隆得到了1053bp和962bp的内含子2和3序列,两序列含有内含子的一般特征-“GT-AG”规律,表明得到的序列为内含子的全长序列(NCBI登录号为:EU104684)。经分析发现,猪、人、小鼠和牛内含子2和3序列的相应长度分别为:1028bp、1046bp、1061bp、1062bp和949bp、964bp、1002bp、961bp;山羊BMP-4基因内含子2和3与它们相应序列的同源性分别为:83.80%、76.03%、66.94%、96.71%和87.15%、80.24%、67.20%、98.13%。得到的启动子部分序列长度为:676bp(NCBI登录号为:EU679369)。3将BMP-4成熟肽片段克隆入pET32a原核表达载体,在E.coliBL21(DE3)plysS实现了表达,表达的蛋白大小为31kDa,其中成熟肽为13.1kDa。根据蛋白的表达量对诱导条件进行优化,适宜的诱导条件为:0.5mMIPTG、22℃、诱导8h。参照分子克隆实验指南的方法对重组蛋白进行亚细胞定位,结果显示重组蛋白主要以包涵体的形式存在,胞质和周质中也有少量蛋白表达,而培养液中则没有重组蛋白出现。4通过半定量RT-PCR方法检测了黄淮山羊BMP-4基因7种组织的RNA表达谱,检测结果表明这7种组织中均有BMP-4基因的表达,其中BMP-4基因在肾脏中的表达量最高,其次为脾脏、肝脏和卵巢,而在胰腺、肺脏和心脏中的表达量较低。这个结果说明,BMP-4基因在各组织中的表达具有组织特异性。