各国对中小企业在国民经济发展中的重要性已经达成共识，纷纷采取多种政策措施促进中小企业的发展，以期更好发挥中小企业的作用。比如，中国政府着手建立了促进中小企业发展的政策体系，包括中小企业的市场准入政策、税收优惠政策、财政支持政策，并正在建立信用体系和服务体系。 但是，每一个中小企业在动态发展中普遍面临着的融资难、行业规制等等问题，并不能仅仅依靠政府政策的扶持而迅速解决所有问题。因此，需要积极探索中小企业发展的新思路，在实践基础上抽象出具有普遍性的理论与观念，进而更好地指导中小企业的发展。 鉴于上述原因，本论文采用跨学科的研究方法，以热力学中的耗散结构理论为分析基础，探讨商业生态系统的自组织作用以及条件；更加妥帖、逼近地反映中小企业在发展中与外界纷繁复杂的动态关系，来研究中小企业发展的商业生态系统的构建问题。 本论文分为两条主线，一方面是以热力学中的耗散结构理论作为理论支撑，试图得出耗散结构理论中自组织现象发生的条件，从而与中小企业发展的商业生态系统进行联系，并贯穿全文。另一方面，从中小企业发展的商业生态系统的内涵、结构、本质、特征等方面对中小企业发展的商业生态系统进行层层解析。最终，得出结论：我国中小企业构建商业生态系统要遵循互惠共生的原则，构建围绕中小企业发展的经济联合体，形成价值网，努力使得系统形成并且保持自组织，从而商业生态系统中的中小企业与其它利益相关者得以协同进化，共生共荣。 并且，基于商业生态系统的观念，将政府部门纳入中小企业发展的商业生态系统中的一员，阐述了政府在中小企业构建商业生态系统中的能动作用以及具体措施。