黑孢属及相关属真菌多样性和分类学研究

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黑孢属(Nigrospora,syn.Khuskia)和节菱孢属(Arthrinium)是一类非常重要的植物病原真菌,可引起许多经济作物上的重要病害,如叶斑病、茎秆枯萎病以及水果的腐烂病等。还可作为人类致病菌,引起皮肤感染;同时,由于产生的分生孢子具有强烈的散射机制而易存于环境中,可作为过敏原,引起人一系列过敏性疾病,如哮喘和季节性鼻炎等。黑孢属和节菱孢属虽然分布广泛,但是至今为止报道记录的物种很少,属内大部分的种间系统演化关系不明确,很多重要物种存在争议。并且不少物种缺乏足以佐证鉴定的模式标本和菌株,传统上依据形态结构特征为主的分类系统无法解决上述问题。此外,黑孢属目及科的分类地位一直存在争议,没有得到解决。本研究以植物病原真菌中常见的黑孢属和及其相关属(节菱孢属)真菌为研究对象,将形态特征、生理特性、寄主与分子系统发生相结合的多相分类法,解决上述科学问题。  系统发育分析确定了黑孢属隶属于梨孢假壳科。同时,通过多位点(ITS,TEF1-α,TUB2)联合分析,构建了该属的系统发育骨架树,完善了该属概念及其系统演化关系,对在中国分离得到的165株黑孢属真菌进行物种鉴定,得到了11个新种,分别描述并定名为Nigrospora aurantiaca、N.bambusae、N.camelliae-sinensis、N.chinensis、N.guilinensis、N.hainanensis、N.lacticolonia、N.osmanthi、N.pyriformis、N.rubi和N.vesicularis。最新的《国际藻类、真菌及植物命名法则》认可的真菌物种描述语言为英语或拉丁语,本论文采用英语进行物种描述。此外,基于模式标本,对5个已报道过但原始形态描述不完整或不准确的物种进行了重新描述。对黑孢属物种在相关寄主上的分布进行了分析,结果表明该属物种普遍具有较高的寄主多样性,同时,属内的早期演化分支内的物种相比后期演化分支内的物种具有明显更广泛的寄主范围。推测该属物种从广寄主范围到窄寄主范围的进化方向。  研究证明传统上依据孢子形态及分生孢子座形态特征划分的Pteroconium和节菱孢属(Arthrinium)为同属,进而表明这些分类特征在该类群属级分类上不具意义。从竹子等寄主上共分离获得80株节菱孢属菌株,通过(ITS,TEF1-α,TUB2)联合分析,结合形态学特征,描述8个新种:Arthrinium bambusae、A.camelliae-sinensis、A.dichotomanthi、A.guizhouense、A.Jiangxiense、A.obovatum、A.pseudoparenchymaticum及A.subroseum。建立了1个新组合A.vietnamensis,并将A.malaysianum处理为A.vietnamensis的同物异名。通过统计在每一个相关寄主上报道过的该属物种数占该属所有物种的比例,发现禾本科和莎草科是该属物种分布最广泛的2个寄主科。
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