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本文利用SSR标记分析对Xa7进一步精细定位并预测目的基因区域的抗病基因,为目的基因的分离克隆打下基础;发展的Xa7、xa5育种辅助分子标记,为XA7、xa5及两基因的聚合培育铺路。主要结果如下:
1.构建包含3201个单株的IRBB7/IR24的F<,2>群体,用13对在两亲本间具有多态性的 SSR标记将Xa7定位在GDSSR02和RM20593之间,并与标记RM20589、RM20590、 RM20591共分离。完全覆盖Nipponbare的克隆AP006055,部分覆盖AP006454和 AP004989,约118.3 kb的距离。。
2.采用TIGER对标记GDSSR02和RM20593之间的DNA序列进行分析,筛选含有与抗性有关保守结构的基因。经过筛选,共得到1个含有NBS结构的候选基因,1个含BTB/POZ结构的候选基因。分布在克隆AP006055上和克隆AP004989,按排列顺序分别命名为Xa7-10和Xa7-13。
3.在Xa7精细定位的基础上,挑选与目的基因左右紧密连锁的8对SSR标记,对IRBB7与40个广东骨干品种进行多态分析,结果有7对SSR标记在IRBB7与其它育种品种间均具有多态性。
4.在前人精细定位xa5的基础上,挑选与目的基因左右紧密连锁的10对SSR标记,对IRBB5与40个广东骨干品种进行多态分析,结果有6对SSR标记在IRBB5与其它育种品种间均具有多态性。
5.用开发的基于Xa7及xa5辅助育种的分子标记来检测了7个杂交组合后代。结果只有两个Xa7与相关的杂交组合后代有目的基因的转入,与xa5相关的杂交组合后代都没转入目的基因。