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对虾白斑综合症病毒(White spot syndrome virus,WSSV),桃拉综合症病毒(Taura syndrome virus,TSV)和传染性皮下及造血组织坏死病毒(Infectioushypodermal and hematopoietic necrosis virus,IHHNV)是引起对虾疾病的三种主要的水生动物病毒病原,导致对虾传染性疾病爆发,造成对虾养殖业严重的经济损失。
应用PCR和RT-PCR检测技术对我国海南省2007年8个养殖地区的南美白对虾感染WSSV,TSV及IHHNV情况进行初步调查,结果显示,其中4个养殖场的对虾检测到较高比例的三种病毒在同一宿主体内共感染,2个养殖场出现较高比例的TSV和IHHNV共感染,仅有一个养殖场存在TSV单独感染,刚刚投放虾苗的养殖场没有检测到这三种病原体。此结果揭示我国海南省虾苗是健康的,对虾病毒感染可能是在生长的过程中因为病毒污染的养殖环境和不科学的养殖方法而导致。
作者收集1998年,1999年和2007年在我国浙江省,广东省和海南省爆发对虾白斑综合症的养殖场的对虾,根据WSSV基因组上高变区域:ORF23/24,ORF14/15和ORF94内的可变串连重复区域的变异特征,采用PCR及序列分析方法研究WSSV的不同基因型。根据上述三个变异区域,在我们收集的样品中鉴定了9个基因型,分别在两个重要的高变区呈现逐渐增大的缺失,并且其中两个样品中存在不同基因型共同感染现象。此外,作者增殖了两种基因型的WSSV毒株,为将来比较毒株的毒力差异测定奠定基础。
对海南省6个TSV分离株进行分子进化分析,得出它们与2003,2004和2005年我国广东省及浙江省分离株分子进化距离较近,说明在2003至2007五年期间我国TSV变异较小。为了分析海南省TSV流行株特点,对TSV的CP2基因进行PCR扩增并进行序列分析,结果显示在383个氨基酸序列中有6个变异位点,可作为TSV流行病学追踪的重要依据。