DNA-DNA杂交(molecular hybridization)技术是分析DNA同源性的一种有效手段,是在16S rDNA序列相似情况下确定新种的必须技术。本研究对传统尼龙膜DNA-DNA杂交技术进行了改进,用核酸限制性内切酶Sau3A分别对待测试菌株和参照菌株的基因组DNA进行消化,再分别与不同的寡核苷酸接头进行连接,然后以相应寡核苷酸接头序列作为引物扩增待测菌和参照菌的基因组DNA,其中参照菌株的DNA用地高辛修饰的dUTP标记。将待测菌的DNA固定于尼龙膜并与地高辛标记的参照菌的DNA进行杂交,再显色。最后用DOTS分析软件分析杂交图,算出其间DNA-DNA杂交值。相对传统的尼龙膜DNA-DNA杂交具有快速,灵敏度高和不需特殊仪器等优点。　　 菌株061324分离自文昌红树林土壤的一株具有细胞毒活性的放线菌,具有发达、分支、不断裂的基内菌丝和气生菌丝;孢子链长、直或波曲,着生在气丝上,孢子表面光滑,依据形态特征初步归类为链霉菌。根据菌株061324及相近的链霉菌的16S rDNA序列的系统发育分析,菌株061324与Streptomycescheonanensis NBRC100940T和Streptomyces carpaticus AS4.1621T处于一个独立的分支,16S rDNA序列的相似性分别为99.2％和99.4％,DNA-DNA杂交的结果分别为46.7％和48.06％。菌株061324的细胞壁组分中含有LL二氨基庚二酸和甘氨酸,不含特征性糖;甲基萘醌组分为MK-9(H8),MK-9(H6),MK-9(H4);其最大耐盐度达12％;(G+C)mol％为73.03％。确定菌株061324是链霉菌属的一个新的分类单元,定名为文昌链霉菌(Streptomyces wenchangensis)。