公立医院改革一直是我国医疗服务体系改革的重点,2010年12月28日,我国财政部会同卫生部新颁布的《医院财务制度》明确要求公立医院实行全面预算管理,要求医院所有收支均应纳入到全面预算管理体系,新制度对医院预算的编制、预算的调整、预算的批复和执行以及预算的分析和考核做了详细的规定,新的财务制度于2012年1月1日起在全国范围内实施。全面预算编制作为全面预算管理的重要组成部分,在全面预算管理中有着承上启下的重要作用,全面预算编制是否科学合理,关系到全面预算管理能否在医院发挥应有的作用,因此对目前公立医院全面预算管理过程中预算编制存在的问题进行研究就显得十分重要。基于以上背景,论文运用文献研究法、归纳分析法、实践调查法和案例分析法,以公共管理理论、委托代理理论、目标管理理论和控制理论为支撑,通过对目前我国公立医院全面预算编制现状的分析,发现我国公立医院全面预算编制存在医院重院级预算编制,轻部门预算编制、院级预算编制内容不完整、全面预算编制方法单一以及全面预算编制松弛,质量不高等主要问题,针对问题及其产生的原因,论文重点探讨和研究了相应的对策,提出在公立医院全面预算编制过程中要牢固树立全面预算管理理念、提高医院预算人员专业素质、建立健全全面预算编制机构机制、预算编制应统筹兼顾,全面开展、多种预算编制方法相结合以及认真落实“两上两下”预算编制流程等合理化建议,并通过A医院案例做了进一步理论和实践研究。