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GPR54基因变异会影响牛初情期启动，本研究采集皖东牛（22头）血液样品，提取皖东牛血液白细胞总RNA，通过对样本牛血液GPR54调控区SNPs检测，多态片段基因型鉴定，通过实时荧光定量PCR分析不同基因型GPR54表达水平，采用RNA-Seq技术分析不同基因型牛GPR54与初情期相关基因转录水平及信号通路之关联性。结果表明: 1.检测出皖东牛GPR54基因启动子区SNPs，获得2个位点，基因型组合分别为CCTT（A组）、CTTC（B组）和TTCC(C组)。 2.不同基因型牛的GPR54基因表达水平显示为CCTT＞CTTC＞TTCC。CTTC型GPR54基因表达水平介于两个纯合型之间。 3.由RNA-seq技术共测了8个样品，平均产生了24136079条原始reads，clean reads平均数目为23739830。与参考基因和参考基因组比对，得出clean reads的平均比对率为分别是59.97％和91.22％。 4.通过RNA-seq检测，A（CCTT型）组和B组（CTTC型）共测得差异基因16719个，其中上调基因6778个，下调基因9920个。通过对差异基因筛选结果进行分析，发现大量与初情期启动相关的基因。如对青春期启动具有抑制作用的GABA、NPY;兴奋性因素有胶质细胞分泌的TGF和IGF，以及GPR54/Kiss-1;另外还有雌激素受体基因(ER)和性激素结核球蛋白基因(SHBG)都与初情期启动相关。 5.通过对差异基因Pathway分析，选择2个富集的通路，包括GnRH信号通路和Estrogen信号通路。分析位于该信号通路的差异基因，发现CaM基因显著下调(P＜0.05)。