地方病、常见病与基因相关性研究——燃煤型氟中毒与维生素D受体基因多态性及贵州侗、汉族HBV感染与趋化因子RANTES基因及其受体CCR5基因多态性的相关性研究

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第一部分:燃煤型氟中毒与维生素 D受体基因多态性相关性研究  目的:探讨贵州省毕节地区燃煤型氟中毒人群维生素 D基因 FokI位点、TaqI位点及 BsmI位点(3个 SNP位点)多态性与燃煤型氟中毒发病的相关性。  方法:在贵州省燃煤型氟中毒地区随机抽样。根据根据氟斑牙程度确定208名氟斑牙患者为氟中毒疾病组,92名村民作为病区内对照组。同时在非病区随机抽取150名村民作正常对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测各组维生素 D受体基因FokI F/f位点、TaqI T/t位点及 BsmI B/b位点基因多态性,并构建单倍型。  结果:VDR(Vitamin D receptor,VDR)基因 BsmI、FokI位点基因型及等位基因频率氟中毒组分别与氟中毒内对照组和正常对照组比较差异有统计学意义(P均<0.05),VDR基因 TaqI位点基因型及等位基因频率在上述三组间比较,差异无统计学意义(P均>0.05)。氟中毒内对照组与正常对照组比较 VDR BsmI、FokI位点基因型及等位基因频率分布无统计学意义(P>0.05)。单因素分析显示携带 bb基因型和ff基因型的个体增加了发生氟中毒的风险。  构建单倍型发现由VDR FokI-TaqI-BsmI构成单倍型频率大于5%有四种,其中f/T/b、F/T/B单倍型在疾病组与对照组分布频率差异有统计学意义(P均<0.05)。F/T/b、f/T/B单倍型在疾病组和对照组分布频率差异无统计学意义(P均>0.05)。携带f/T/b、F/T/B这两种单倍型的人可能对氟中毒易感。  结论:1.本研究结果显示VDR基因BsmI B/b、FokI F/f单个SNP位点突变可能与氟中毒易感性相关。  2.成功构建 VDR3个 SNPs单倍型,推测 f/T/b,F/T/B单倍型结构人群可能与氟中毒易感性相关。  第二部分:贵州侗、汉族 HBV感染与趋化因子 RANTES及其受体 CCR5基因多态性的相关性研究  目的:探讨贵州世居少数民族—从江侗族及毕节汉族趋化因子RANTES(Regulated on activation,normal T-cell expressed and secreted,RANTES)及趋化因子受体5(chemokine receptor5,CCR5)基因多态性与乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染的相关性。  方法:  1.采用实时荧光定量(Real-time PCR) TaqMan-MGB SNP分析的方法分析RANTES-28C/G(rs2107538),-403G/A(rs2280788)及CCR559029A/G(rs1799987)、59353C/T(rs1799988)4个SNPs位点多态性。  结果:  1.RANTES基因:  1)RANTES-28C/G基因型分布在从江侗族人群与毕节汉族人群感染组比较差异有统计学意义(P<0.05),RANTES-403A/G基因型在从江侗族人群及毕节汉族人群中分布比较差异无统计学意义(P>0.05)。  2)民族总体人群RANTES-28C/G,-403A/G在感染组与非感染组比较无统计学差异(P>0.05);风险度分析发现携带-28GG和-403GG基因型的个体 HBV感染的风险度高(OR=1.425,OR=1.137)。  2.CCR5基因:  1)民族总体人群 CCR559029位点在感染组与非感染组比较有统计学差异(P<0.05),风险度分析发现携带CCR559029AA基因型个体HBV感染的风险度高(OR=2.692)。CCR559029G/A基因型在从江侗族感染组和非感染组人群分布比较差异有统计学意义(P<0.05)。CCR559029G/A基因型在毕节汉族感染组和非感染组人群分布比较差异有统计学意义(P<0.05)。CCR559029G/A基因型在从江侗族人群及毕节汉族人群中分布比较差异无统计学意义(P>0.05)。  2)民族总体人群 CCR559353C/T位点在感染组与非感染组比较有统计学差异(P<0.05),风险度分析发现携带CCR559353CC及CT基因型个体HBV感染的风险度高(OR=2.447,OR=2.447)。CCR559353C/T基因型在从江侗族感染组和非感染组人群分布比较差异有统计学意义(P<0.05)。CCR559353C/T基因型在毕节汉族感染组和非感染组人群分布比较差异有统计学意义(P<0.05)CCR559353C/T基因型在从江侗族人群及毕节汉族人群中分布比较差异无统计学意义(P>0.05)。  3.单倍型分析  用RANTES-403A/G、-28C/G构成单倍型显示GG、AG、AC、GC在感染组和正常组分布差异具无统计学意义(P>0.05)。CCR559029G/A、59353C/T构成单倍型GT、AT、AC在感染组和正常组分布差异具有统计学意义(P<0.05)。提示 CCR559029G/A、59353C/T所组成单倍型GT、AT、AC对HBV易感。  结论:  1. CCR559029G/A、59353C/T位点多态性与HBV感染情况可能存在相关性。  2. RANTES-28C/G,-403A/G位点多态性在本次研究人群中与HBV感染无相关性。  3.携带CCR559029G/A、59353C/T所组成单倍型GT、AT、AC HBV感染组与非感染组之间分布差异有统计学意义。
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