系统性红斑狼疮I型干扰素通路和Th17通路易感基因的交互作用研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liubmhz
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:系统性红斑狼疮(SystemicLupusErythematosus,SLE)是一种典型的自身免疫性疾病,以大量自身抗体产生、补体激活和免疫复合物沉积为主要特征,导致组织和器官损伤。目前,SLE的病因和发病机制仍未完全阐明。已有证据表明,SLE的发病是由多种风险因素共同作用的结果,其中,遗传因素起了关键作用。随着功能候选基因和全基因组关联研究(Genome-WideAssociationStudies,GWAS)相关技术的发展,目前已发现了几十个新的SLE遗传易感基因。虽然如此,SLE的遗传度并不能完全由这些已发现的易感基因所解释,而基因-基因的交互效应可能解释了部分“缺失的遗传度(MissingHeritability)”。  目的:拟选择两条关键的免疫信号通路[I型干扰素信号通路和Th17(THelp17Cell)细胞信号通路],来检测相关基因多态性是否与中国汉族人群SLE遗传易感性相关。同时,检测相关基因间是否存在基因-基因交互作用。  方法:分两阶段进行研究。第一阶段,选择的基因主要为GWAS或大样本的候选基因研究方法报道的中国汉族人群易感基因(I型干扰素和Th17细胞信号通路);第二阶段,鉴于Th17细胞已成为研究自身免疫性疾病(包括SLE)病因及发病机制的一个热点。本研究拟在前期基础上,进一步加大样本量,深入研究Th17细胞信号通路相关易感基因间的交互作用。两阶段的病例样本来自于安徽医科大学附属省立医院风湿免疫科和安徽医科大学第一附属医院风湿免疫科的SLE患者。SLE的诊断依据1997年美国风湿病学会修订的SLE分类标准。对照样本来自于健康献血者。SNP(SingleNucleotidePolymorphism)分型采用SequenomMassARRAY技术。卡方检验和Logistic回归用于评估基因多态性与SLE遗传易感性的关联。我们主要运用参数的交互作用分析方法进行基因-基因交互效应检测,包括相乘的交互作用(MultiplicativeInteraction)和相加的交互作用检测(AdditiveInteraction)。  结果:第一阶段最终纳入858例SLE患者和967例健康对照样本进行分析。关联研究验证了IL21(rs907715)与中国汉族人群SLE遗传易感性相关[OR=0.84,95%可信区间(ConfidenceInterval,CI)=0.74-0.96,P=0.01]。校正年龄和性别后,我们发现ETS1和IL21基因存在显著相乘和相加的交互效应:(1)相乘交互作用:ETS1(rs6590330)与IL21(rs907715)(显性模型,β=0.58,P=0.03),ETS1(rs6590330)与IL21(rs2221903)(共显性模型,β=0.26,P=0.02);(2)相加交互作用:ETS1(rs6590330)与IL21(rs907715)[交互作用超额相对危险度(TheRelativeExcessRiskduetoInteraction,RERI)=0.73,95%CI=0.33-1.13,P=3.29×10-4;交互作用归因比(AttributableProportionduetoInteraction,AP)=0.44,95%CI=0.14-0.74,P=4.62×10-3],ETS1(rs6590330)与IL21(rs2221903)(RERI=0.59,95%CI=-0.09-1.26,P=0.09;AP=0.30,95%CI=0.002-0.60,P=0.05)。此外,还发现IRF5(rs4728142)与IKZF1(rs4917014)存在相加的基因-基因交互作用趋势。第二阶段最终纳入1481例SLE病人和2266例健康对照进行分析。关联研究验证了3个基因(SNP)与中国汉族人群SLE遗传易感性相关:IL21(rs6835457)(OR=0.88,95%CI=0.80-0.96,P=4.84×10-3),PPP2CA(rs7704116)(OR=1.60,95%CI=1.31-1.96,P=3.35×10-6),IFNG启动子SNP(rs2069705)(OR=1.13,95%CI=1.01-1.26,P=0.04)。校正年龄和性别后发现:(1)相乘交互作用:IL21(rs6835457)与ETS1(rs6590330)(显性模型,β=0.41,P=0.02)、IL21(rs6835457)与TBX21(rs4794067)(隐性模型,β=1.05,P=0.03);(2)相加交互作用:IL21(rs6835457)与ETS1(rs6590330)(RERI=0.57,95%CI=0.26-0.87,P=2.71×10-4;AP=0.34,95%CI=0.13-0.55,P=1.63×10-3),TBX21(rs4794067)与IFNG(rs2069705)[RERI=-0.44,95%CI=-0.81-(-0.08),P=0.02;AP=-0.45,95%CI=-0.88-(-0.03),P=0.04]。  结论:本次研究验证了上述信号通路部分基因(SNP)与中国汉族人群SLE遗传易感性相关。此外,我们发现两条信号通路中相关易感基因存在着相乘或相加的基因-基因交互效应。这些结果提示基因变异与基因-基因交互作用共同增加了SLE的发病风险。
其他文献
遵照毛主席“教育必须为无产阶级政治服务,必须与生产劳动相结合。”的教导,我们于去年结合教学,进行玉米双季丰产试验,由于上级党委的正确领导,广大贫下中农和工农兵学员的
目的甲醛是确认的人类致癌物,是一种无色的刺激性气体,其应用广、毒性大、污染时间长,是室内空气中的主要污染物,对人体的危害极大。为了降低甲醛对人体的危害,寻找拮抗甲醛毒性的物质并研究其拮抗机理,是广大科学工作者所面临的重要课题。姜黄素(curcumine)是从中草药姜黄(curcuma aromatica)中提取的一种天然食用色素。可溶于甲醇、乙醇、碱、醋酸、丙酮和氯仿等有机溶剂,具有抗炎、抗氧化、
近几年来,我国棉花育苗移栽发展很快。一九七六年据不完全统计,全国棉花移栽面积近六百万亩,比一九六五年增加六倍多。不仅育苗移栽技术有显著发展,而且应用范围日益扩大,具
一、美国电视媒介批评的种类1.新闻报道式批评整体上看,美国的电视批评可以划分为新闻报道式批评和学术研究性批评两种。20世纪40年代美国电视大规模商用之前,新闻报道式批评
新媒体动漫之新首先体现在技术上,根本在创意上。十多年来中国新媒体发展迅猛,从早期的个人网络动画到高校新媒体动漫艺术的积累,新媒体动漫进入到一个成熟期。但也存在一些
结合当前网络故障诊断的发展情况 ,提出了一种适合远程诊断的神经网络方法和基于此方法的远程网络故障诊断模型 ,实现了诊断的智能化 .最后通过一个实例 ,验证了此模型的可行
1.沤改旱在田间工程上的要求是深沟狭畦,改善土壤水分条件。畦宽6至7尺,一般沟深1尺,腰沟和边沟深1.2尺。2.新沤改旱田一定要施用灰肥或磷肥。磷肥用量与土壤肥力状况和播种
在广播电视产业中,随着市场化运行机制的逐步建立,品牌的塑造和经营具有重要意义。品牌不仅代表了广播电视媒介及栏目的形象,也意味着优良的品质和鲜明的个性。媒介品牌既具
目的:本次研究主要是通过分析某石油炼制企业汽油、含硫气体、氨、苯接触作业人员的职业健康状况,了解该企业生产环境中存在的主要化学性有害因素在低浓度、长期接触的条件下,作