国内外学者对于高等教育经费投资问题的研究不在少数,但多数是以国家为对象进行研究,本文以地方政府投资视角为切入点,研究内蒙古政府投资高等教育的行为。文章以教育经济学理论、公共产品理论、新制度经济学理论作为研究依据,运用了多种方法等进行了研究。以政府投资为主体,积极拓展多种投资渠道的投资方式,是高等教育投资未来的发展趋势。政府作为高等教育的主要投资者,既是高等教育发展的客观要求,也是市场经济条件下无法避免的“市场失灵”的必然选择。但政府投资高等教育由于体制性的缺陷、经济发展水平的制约等,存在着不少问题,从而影响了内蒙古高等教育的发展。本文通过对内蒙古政府投资现状的分析,指出政府在投资高等教育过程中存在的问题,并通过对投资的影响因素分析,提出优化政府投资的建议,形成结论：在不断做大“财政”这块蛋糕的同时,重新定位政府、高校、社会三者的关系,改变高等学校对政府投资的过度依赖,充分利用市场的运行机制改变高等教育与社会发展脱节的现状,让内蒙古自治区的高等教育在内蒙古经济的快速发展中呈现出健康、蓬勃发展的新局面。