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从重大环境污染事故罪到污染环境罪，经过多次修改之后，保护法益日渐明朗，在我国需要确定生态中心法益观。生态中心法益观是指保护生态环境为主，保护国家管理制度和人身安全和公私财产为辅的法益观。我国在认定污染环境罪时存在主观方面认定不明，因果关系证明困难，诉讼时效与污染环境罪本身的特点不相适，污染环境罪和投放危险物质罪的区分等问题，在生态中心法益观的指导下，完善污染环境罪的认定可以从以下几个方面入手，明确主观方面，设置与之适应的刑罚，委托专门机构调查取证，明确侵害法益，延长追诉时效，区分污染环境罪与投放危险物质罪的处断。