崇明岛土壤可培养微生物多样性分析及新种鉴定

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为了解崇明岛土壤样品中可培养微生物种群的多样性信息,采用稀释平板法,对崇明岛土壤样品中可培养细菌进行了分离,并对其16S rDNA序列进行了分析。结果从崇明岛光滩,芦苇,海三棱藨草生长区域的土壤中分别分离得到26,28,30株菌落形态差异的菌株,经16S rDNA序列分析表明:这三个采样点的菌株可归属到17,11,13个属中。噬冷菌属和芽胞杆菌属为三个采样点所共有的菌属。分别占所分离的总菌株数的14.9%和16.3%。从芦苇生长区域的土壤中分离的编号为LW29,LW30菌株与已报道标准菌株的16S rDNA序列的相似性为95%~96%,经鉴定是属于黄杆菌属的新种,对其进行了形态特征,生理生化结果及16S rDNA系统发育分析。采取相同的方法,再次针对多样性指数最高的光滩泥土样品进行分析,得到一株编号为JM27的菌株,与已报道标准菌株的16S rDNA序列的相似性低于97%,可能是属于Altererythrobacter的新种,对其进行了新种鉴定的相关试验。
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