南海北部水体颗粒物吸收系数(ap(λ))、非藻类颗粒物吸收系数(aNAP(λ))和浮游植物吸收系数(aph(λ)的变化很复杂；沿岸及珠江口近海的ap(λ)主要由非藻类颗粒物控制，非藻类颗粒物的贡献由沿岸向外海逐渐减小。在南海北部开阔海区，ap(λ)与叶绿素a浓度有较好的幂指数相关性(R2分别大于0.69)。非藻类颗粒物吸收系数随波长增大按指数规律减小，珠江口及广东沿海水体SNAP的平均值为0.012 nm-1，南海北部开阔海域水体SNAP的平均值为0.009 nm-1，SNAP表现出由沿岸向外海减小的趋势。对于广东沿海水体，单位质量的悬浮颗粒物吸收系数平均为0.045 m2 g-1。　　 浮游植物比吸收系数a*ph(λ)随海区而变，近岸a*ph(λ)明显低于外海，如珠江口及广东沿岸海区a*ph(440)平均为0.065 m2·mg-1，南海北部开阔海域a*ph(440)平均为0.139 m2·mg-1。a*ph(λ)与叶绿素a浓度之间有较好的幂指数关系，与遥感反射率也有较好的相关关系。a*ph(λ)的变化主要由色素细胞粒径和色素成分决定，粒径变化对a*ph(440)、a*ph(675)的变化的贡献分别为42％和33％；在沿岸和外海，辅助色素对a*ph(440)的贡献平均分别为44.4％和52.9％。不同海区浮游植物吸收系数具有典型的特征光谱信息，这些特征光谱为利用光学遥感技术反演某些浮游植物种群的特征色素提供了可能。　　 近岸和外海水体漫射衰减系数的变化与颗粒物吸收系数的变化有关。在珠江口，非藻类颗粒物、黄色物质是决定Xd(λ)的主要因素，光合有效辐射的穿透深度约为2m，且红光是穿透光辐射的主要成分；在珠江口伶仃洋至万山群岛水域、大亚湾和广东沿岸的大部分水域，光合有效辐射的穿透深度约为10m以内，且随深度的增加绿光成为穿透光辐射的主要成分；在南海北部开阔海区，叶绿素a是决定Kd(λ)的主要因素，光合有效辐射的穿透深度可达80m以下。且随着深度的增加蓝光是穿透光辐射的主要成分。不同波段漫射衰减系数Kd(λ)与Kd(490)之间有很好的相关性(决定系数R2大于0.84)。