论文部分内容阅读
目的：
探讨DNMT3A和DNMT3B启动子区SNPs与胃癌、食管癌的遗传易感性的关系。
方法：
①提取待检人群外周血基因组DNA。②采用PCR-RFLP结合DNA测序技术检测DNMT3B启动子区SNPs位点-149C>T和-579G>T在待检人群中的频率分布，用SPSS13．0统计学软件分析实验结果。③荧光素酶活性分析检测DNMT3B SNP-579G>T对其启动子活性的影响。④在线预测DNMT3A候选启动子序列，筛选出启动子区SNP位点-448A>G，荧光素酶活性分析检测DNMT3A SNP-448A>G对其启动子活性的影响。⑤采用PCR-RFLP结合DNA测序技术检测此位点在待检人群中的频率分布，并评估该位点与胃癌、食管癌的遗传易感性。
结果：
①189例健康对照组中DNMT3B-149C>T位点TT/CT基因型频率为98．9％/1．1％；195例食管癌病例组中TT/CT基因型频率为97．9％/2．1％；308例胃癌病例组中TT/CT基因型频率为97．9％/2．1％。DNMT3B-149C>T位点TT/CT基因型频率在健康对照组和食管癌、胃癌患者中分布差异均没有显著性（P=0．43，P=0．62），健康对照组与病例组中均未检测到CC基因型。②在350例健康对照组中DNMT3B-579G>T位点TT/（GT+GG）基因型频率为79．7％/20．3％，197例食管癌病例组中为78．2％/21．8％，313例胃癌病例组中为88．2％/11．8％。DNMT3B-579G>T位点TT基因型的个体与对照组相比，其患胃癌的易感性明显升高（P=0．003，OR=1．90，95％CI：1．23-2．92）。含有DNMT3B-579G>T位点T等位基因的DNMT3Bpromoter-pGL3-Basic重组质粒转染CHO细胞24h后，荧光素酶活性约为含有G等位基因的2．5倍（P<0．001）。④在DNMT3A转录起始位点上游791bp-741bp找到最佳启动子候选序列。④在291例健康对照中DNMT3A-448A>G位点（AG+AA）/GG基因型频率为34．7％/65．3％。⑤含有DNMT3A-448A>G位点A等位基因的DNM73A启动子序列片段-pGL3-Basic重组质粒转染CHO细胞24h后，荧光素酶活性为含有G等位基因的2．1倍（P<0．001）。⑥DNMT3A-448A>G位点（AG+AA）/GG基因型在97例食管癌病例组中频率为36．1％/63．9％，208例胃癌病例组中为51．0％/49．0％。携带DNMT3A-448A>G位点（AG+AA）基因型的个体与健康对照组相比，其患胃癌的易感性明显升高（P<0．01，OR=1．96，95％CI：1．36-2．81）。
结论：
1．DNMT3B启动子区-149C>T位点SNP在不同人种间有显著差异。
2．DNMT3B启动子区-579TT提高了DNMT3B启动子活性，并与胃癌的遗传易感性有关联。
3．DNMT3B启动子区-149C>T与胃癌、食管癌的易感性无明显的关联，提示该位点不适合作为SNP位点来评价中国汉族人群食管癌、胃癌遗传易感性。
4．DNMT3A-448AA提高了DNMT3A启动子活性，并与胃癌的遗传易感性有关联。
5．DNMT3A-448A>G位点为评价胃癌遗传易感性的新的位点，并成为胃癌的一个风险因素。