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为探究新疆尉犁县胡杨内存液中内生微生物的群落构成，本研究利用免培养方法对其中细菌、古菌和真菌的多样性进行了研究，通过直接提取胡杨内存液中总DNA，分别使用细菌、古菌和真菌通用引物进行rRNA基因扩增，构建相应的rRNA基因文库。1.细菌16S rRNA基因文库中随机挑选400个阳性克隆，用Hae III酶切分型后测序，共得到48个可操作分类单元（OTUs），系统发育分析结果表明，48个OTUs分别属于厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteria）、变形菌门（α-, β-, γ-proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）和疣微菌门（Verrucomicrobia）。其中变形菌门γ亚群（Gamma-proteobacteria）为优势类群，占整个细菌克隆文库的53%。2.古菌16S rRNA基因文库中随机挑选52个阳性克隆，Hae III酶切分型后测序，共得到4个OTUs，系统发育分析结果表明，4个OTUs均归类于广古菌门（Euryarchaeota）中的甲烷囊菌属（Methanoculleus）。3.真菌运用运用两对特异性引物对rRNA基因进行PCR扩增，分别构建了真菌18S rRNA基因克隆文库与真菌ITS rRNA基因克隆文库。其中真菌18S rRNA基因克隆文库共得到13个OTUs，其中仅有5个OUTs归属于真菌类群，其余8个OUTs归属于真核生物的囊泡藻界（Chromalveolata）及有孔虫界（Rhizaria）当中的类群；真菌ITS rRNA基因文库中随机挑选148个阳性克隆，用Hae III酶切分型后测序，共得到8个OTUs，系统发育分析结果表明，胡杨内存液内生真菌克隆文库8个OTUs均归属于子囊菌门（Ascomycota），并且98%的克隆子属于不可培养真菌类群。研究结果表明，新疆尉犁县胡杨内存液中内生细菌多样性丰富，具有较高的内生细菌菌种资源，而古菌及真菌群落结构较单一。本文首次运用免培养法对胡杨内存液中微生物群落结构及多样性进行了研究，该数据可为胡杨内生可培养微生物资源的分离，纯培养提供一定的参考。