青藏高原及周边高山区域古地质运动与气候波动造成的多样性地形和丰富多变的环境对生物的进化产生了深远影响。为了认识在这一区域分布的莛子蔗属（忍冬科）两物种的谱系地理模式、动态历史以及物种形成机制，我们对穿心莛子蔗20个居群的238个个体的3个叶绿体DNA片段（rbcL-accD，rps15-ycf1和trnH-psbA）和莛子蔗13个居群所有个体的2个叶绿体基因片段（rbcL-accD，rps15-ycf1）与1个低拷贝核基因片段(AT103)进行测序分析。主要研究结果与结论如下:　　(1)穿心莛子蔗叶绿体联合序列检测到19个单倍型。整体分布具有较高的遗传多样性。根据穿心莛子蔗遗传多样性从横断山脉核心区向东喜马拉雅和横断山北缘递减这一趋势，结合单倍型星状网络关系，我们推断其经历了西向和北向的分布范围扩张。对当前、全新世中期、末次盛冰期(LGM)和末次最大间冰期四个时间段的分布重建结果有力支持穿心莛子蔗LGM分布范围急剧收缩、全新世中期后重新扩张的推论。西向扩散的通道应该是狭长的喜马拉雅山地和雅鲁藏布峡谷，而北向迁徙走廊应该为南北走向的山脉山坡和位于山脉间的低海拔谷地，因为这两个区域都有穿心莛子蔗居群的分布;横断山核心区穿心莛子蔗起源分化中心和冰期避难所的角色;东喜马拉雅区域较高比例特有单倍型的出现可以归因于多变气候和多样环境形成的强大选择压力造成了穿心莛子蔗的快速分化。　　(2)确定莛子蔗叶绿体基因7个单倍型，核基因5个单倍型。位于高原边缘和周边区域的莛子蔗居群具有较高水平的单倍型多样性和特有单倍型比例。我们还发现莛子蔗单倍型多样性有从高原外围往台面递减的结构。遗传多样性结构、单峰失配分布和中性检验结果都支持分布范围扩张的假设;青藏高原边缘和周边的部分地区为莛子蔗潜在的微型避难所;另外，叶绿体联合序列的分化水平高于核基因序列，我们认为原因是叶绿体为母系遗传，而莛子蔗种子的扩散能力弱于花粉，所以会出现这一现象。　　(3)对两个高山草本植物物种形成只进行了初步分析，我们推测很可能是冰期两者的共同祖先物种被冰川和地理距离阻隔，形成地理隔离，进而造成了不可逆的生殖隔离。我们还对两个物种的避难所模式进行了比较。但是，为在以后的研究中得到更加可靠、科学的结论，还需要做深入的、全面的分析。