有效的遗传方法的研究和单核甘酸多态的大量收集,为人类疾病基因的研究提供了有力的工具。当位点数比较多时,针对病例-对照组的标准x~2检验统计量(用一个线性函数作用于单倍型或等位基因的概率分布)有较小的功效。因此,对于基因关联研究,我们提出了一种新的方法。当有大量位点时我们建立一个新的统计量:用一个非线性函数作用于单倍型或等位基因的概率分布,以此来增加在病例组和对照组中单倍型或等位基因频率的差异进而获得较高的功效。已有Jinying Zhao等人通过研究基于熵(一个非线性函数)的检验统计量和标准x~2统计量之间的关系得出,在大多数情况下,基于熵的检验统计量比标准x~2检验统计量的功效高。本文就是利用另外一个关于单倍型频率的非线性函数—“互信息”建立一个新的检验统计量,然后比较基于熵的统计量和基于互信息的统计量的功效。通过模拟证实在大多数情况下基于互信息的统计量的功效高于基于熵的统计量。