沼气是一种可再生的、清洁的和重要的温室气体负净排放生物质能源,其生产过程是一个由大量的微生物介导的过程。了解参与沼气发酵的微生物种类和这些微生物的协作关系,对于更好的设计和优化沼气发酵工艺是非常必要的。本研究对采集自全国不同地区的、包含各种发酵底物的、生产规模的大型沼气发酵工程的沼气发酵样品进行了宏基因组研究,以揭示与沼气发酵相关的为微生物类群。其中,对采集自江苏样品的研究,我们构建出一个包含1.18Mb基因的参考序列,并通过将不同样品的测序数据比对到该参考序列上,比较不同研究条件对沼气发酵微生物的影响。结果表明不同的样品起始量对沼气发酵微生物没有影响,而不同DNA提取试剂盒将对沼气发酵微生物群落结构产生影响,但对于不同的底物发酵样品,影响程度有差异。同时,不同底物发酵的沼气发酵微生物纯在明显差异。目前,我们对采集自全国的116个样品进行了宏基因组测序,并获得了 3.5 Tb的原始数据,该数据正在进一步的处理中。通过对这一批数据的分析,我们将获得一个完整的关于沼气发酵的微生物基因集。