蒟蒻薯属(Tacca)植物DNA条形码的筛选和考虑须(Tacca chantrieri)的谱系生物地理学研究

来源 :中国科学院研究生院 中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wolovenorton
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(1)蒟蒻薯属(Tacca)属于薯蓣科,由于该属植物种间在形态上差别不大导致分类上很有难度。DNA条形码是一种利用短的DNA标准片段来鉴别和发现物种的方法。本研究利用核片段ITS和叶绿体片段trnt-psbA,rbcL,matK对该属植物6个种的36份样品的进行PCR扩增和测序,比较各序列扩增和测序效率,种内种间变异,barcode gap,采用Tree-based和BBA两种方法比较不同序列的鉴定能力。结果显示:单片段ITS正确鉴定率最高,联合片段rbcL+matK正确鉴定率最高。因此,推荐rbcL+matK片段为该属物种鉴定的条码,ITS为候选条码。同时丝须蒟蒻薯Tacca integrifolia样品中的西藏居群和马来西亚居群被分成了2个不同的遗传分支,且两者形态上也有所差距,极有可能是个新种。本研究结果表明CBOL推荐的通用条形码能够快速准确鉴定蒟蒻薯属植物。   (2)老虎须隶属于蒟蒻薯属,广布于印度—马来地区,该地区具有丰富的植物区系多样性,被认为是旧热带的中心部分和冰期的避难所,很长时间以来人们对于老虎须的起源地及群体动态变化众说纷纭,ISSR的研究结果曾显示贯穿云南西北到东南的田中线对其遗传结构有影响。本研究通过对25个居群共322份样品的叶绿体的trnL-F,trnH-psbA和trnS-G三个片段的序列数据,运用群体遗传学和谱系地理的方法,试图探讨该物种群体动态历史及影响因素。结果表明:三个片段共组成1896 bp的碱基序列,13个多态位点,13个单倍型,且田中线两边无重合单倍型,AMOVA显示居群之间的遗传变异占主要部分,PERMUT结果显示居群具有明显的谱系地理结构(Nst>Gst),中性检验结果为不显著,NCA分析显示NCA分析显示位于H1、H3为原始单倍型,越南普马特和河内老挝万荣地区为物种分布中心,异域片段化可能是造成现今格局的主要因素。  
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