钌多吡啶配合物DNA光裂解机理和效率的理论研究

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钌(Ⅱ)多吡啶配合物具有丰富的光化学、光物理性质、独特的DNA结合能力,在生物领域具有广泛的潜在应用,如可以作为DNA结构探针、DNA分子光开关、肿瘤基因治疗、DNA光裂解试剂等。自从上世纪70年代,Adamson报道了钌(Ⅱ)联吡啶配合物可以作为光敏化试剂之后,人们合成了大量不同结构的钌(Ⅱ)多吡啶配合物,其中中山大学生物无机化学组就合成了上百种的钌(Ⅱ)多吡啶配合物。这些配合物大多具有DNA光裂解性能,然而,其光裂解DNA的机理与规律在实验上尚未真正弄清楚,在理论上的研究更为罕见。因此,在实验的基础上,进行钌(Ⅱ)多吡啶配合物DNA光裂解的机理与效率的理论研究,对于指导新型钌(Ⅱ)多吡啶配合物的DNA光裂解试剂的设计及作用机理分析具有十分重要的意义。 本论文运用Gaussian 03程序包,采用密度泛函理论(DFT)、含时密度泛函理论(TDDFT)、HF(Hartree-Fock)从头计算及单组态相互作用的(CIS)方法,对若干系列钌(Ⅱ)多吡啶配合物的DNA光裂解机理与效率进行理论研究。通过研究实验上报道的具有DNA光裂解性能的插入型钌(Ⅱ)多吡啶配合物的基态和激发态的几何结构、电子结构、激发态的氧化还原势等方面的性质,解释了这些配合物DNA光裂解的机理与效率,获得了这些配合物DNA光裂解效率的一些调控规律,如主配体上不同取代基、取代基的不同位置、主配体骨架上引入N原子以及辅助配体等对光裂解DNA效率的调控等。 本论文共包括五章: 第一章绪论。综述了量子化学的基本方法和钌多吡啶配合物的研究进展,特别是钌(Ⅱ)多吡啶配合物DNA光裂解的研究现状及其理论研究进展,从而阐明本论文所选课题的意义。 第二章钌多吡啶配合物[Ru(phen)2(6-R-dppz)]2+(R=OH,NO2和H)对DNA光裂解机理及取代基效应。主要采用DFT、HF和CIS方法,通过研究配合物[Ru(phen)2(6-R-dppz)]2+(R=OH,NO2和H)(1~3)基态与激发态几何构型、自然电荷分布、以及计算得到的基态和激发态电化学数据,解释了不同取代基钌(Ⅱ)多吡啶配合物可能的DNA光裂解机理以及光裂解效率。计算结果表明,对于配合物1和3,其裂解能力主要取决于相应激发态的还原势;对于硝基取代配合物2,其光裂解DNA的能力除了决定于激发态的还原势外,还受到激发态几何构型畸变的影响。第三章主配体不同位置取代的钌配合物[Ru(bpy)2(L)]2+(L=pip,o-mopip,p-mopip)对DNA的光裂解及其效率。采用DFT/TDDFT,HF和CIS方法计算了[Ru(bpy)2(L)]2+(L=pip,o-mopip,p-mopip)(1-3)的基态和激发态的几何与电子结构,用理论计算的方法获得了它们基态(S0)和最低三重激发态(T1)的氧化还原势。计算得到这些钌配合物(1-3)激发态还原势大于重叠鸟嘌呤的氧化势,且其顺序为E*red(1)<E*red(2)<E*red(3),这与实验观察到的光裂解效率顺序一致。同时从光化学数据看,电子结构的不同导致不同配合物激发态的系间跃迁速率不同{r(3)>r(2)>r(1)),也可以解释它们不同的DNA光裂解效率。 第四章插入配体骨架上氮原子[Ru(pphcn)L]2+(L=pip,pyip,pzip)对钌配合物DNA光裂解效率的理论研究。采用DFT,HF和CIS方法计算了[Ru(phen)L]2+(L=pip,pyip,pzip)(1-3)的几何与电子结构,用理论计算方法获得了它们基态(S0)和激发态(T1)的氧化还原势。从理论上推测了在主配体上增加1个氮原子到增加3个氮原子,可能的DNA光裂解效率的倾向。 第五章不同辅助配体钌(Ⅱ)多吡啶配合物DNA光裂解效率的理论研究。选择了三个系列钌配合物进行研究,采用DFT,HF和CIS方法计算了它们的几何与电子结构,用理论计算的方法获得了它们基态和激发态(T1)的氧化还原势,讨论了辅助配体对钌(Ⅱ)配合物DNA光裂解效率的调控作用。 本论文创新之处:(1)通过计算得到钌配合物的基态和激发态的几何及电子结构(如电荷分布)的变化,在理论上解释了插入型钌多吡啶配合物的DNA光裂解机理,为实验上的光诱导氧化还原机理提供了理论支持。(2)计算了钌多吡啶配合物激发态的氧化还原势,并从计算的配合物激发态的电化学、光化学性质以及几何畸变三个方面很好地解释了若干系列钌(Ⅱ)多吡啶配合物DNA光裂解的效率,得到的结果与实验事实一致。(3)通过理论研究获得了钌(Ⅱ)多吡啶配合物DNA光裂解的一些调控规律。如从主配体取代基、取代基位置、辅助配体及在配体上引入杂原子等方面进行调控。 本论文尚有一些不足之处,如研究的一些系列配合物缺乏在同一实验条件下测定的可作定性/定量比较的数据,使论文的深入讨论、调控规律的总结以至论文的学术水平受到一定的影响。钌多吡啶配合物DNA光裂解机理与效率的研究是当前国际生物无机化学领域的一个前沿、交叉及具有广阔应用前景的课题,本论文的研究工作及其所获得的规律还是很初步的,今后在理论与实验上要更加紧密地结合起来,才能深入进行该课题的研究工作。
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