【摘 要】
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该研究论文是在国家人类基因组南方研究中心的前期关于肝癌基因表达谱分析的基础之上完成.通过构建肝癌及其癌旁组织的cDNA文库,进行大规模的ESTs测序,同时结合生物信息学手
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该研究论文是在国家人类基因组南方研究中心的前期关于肝癌基因表达谱分析的基础之上完成.通过构建肝癌及其癌旁组织的cDNA文库,进行大规模的ESTs测序,同时结合生物信息学手段分析癌和癌旁之间基因表达种类和丰度上差异.旨在转录水平,寻找肝癌及癌旁组织中有明显表达差异的基因,为肝癌的诊断和治疗研究奠定基础.通过ESTs测序的方法,从肝癌/癌旁组织cDNA文库中共得到11,065基因簇,其中3695(33％),3740(34％)和3630(33％)个基因簇分别对应于已知基因,已知ESTs及未曾识别的新ESTs.通过生物信息学方法从这些数据中筛选出50个有表达差异的,且与细胞生长发育相关基因、与细胞周期调控有关的基因.利用RT-PCR等其它分子生物学技术,在更大量的肝癌和癌旁组织中进一步验证,排除大规模测序所造成的误差,以确认这种差异表达的真实存在.在此基础之上,对差异表达基因作深入的研究,以发现有可能的肝癌诊断指标或者发现有助于肝癌治疗的潜在的药物靶点.另外,克隆到一个全长新基因LSB,实验显示其为肝脏特异、肝癌高表达、表达产物定位于胞浆的胞膜侧.信息学显示其与伯纳(Borna virus)P40蛋白质同源.我们的发现提示此基因有可能是一个潜在的药物靶点或肝癌诊断的检测指标.
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