近几十年来DEA模型以其独有的特点和优势成为系统评价发展最快的方法之一,但是对于决策单元指标权重的确定是尚待解决的一个重大课题。DEA模型在决策过程中对指标的权重没有任何限制,选取了对被评价决策单元最有利的权重,不受主观因素影响。这种评价方法虽然具有客观性,但是完全忽视了指标之间重要性的差异,难以保证评价结果的合理性。鉴于此,本文提出了指标偏好DEA模型,并深入研究了其解的性质。首先,构建了指标偏好DEA模型及其对偶模型。基于C~2R模型,根据指标之间客观存在的重要性差异,同时结合决策者偏好,给出指标重要程度的排序,得到相应的权重约束条件,从而构建了指标偏好DEA模型;在分析指标偏好DEA模型的决策变量、约束条件以及目标函数的特征基础上,进而构建了指标偏好DEA模型的对偶模型。与此同时,给出了指标偏好DEA模型有效性的定义,并研究了指标偏好DEA模型及其对偶模型的相关性质,论证了解的存在性,并通过实例验证了指标偏好DEA模型的实用性。然后,构建了基于阿基米德无穷小量的指标偏好DEA模型及其对偶模型。通过引入阿基米德无穷小量,使得各个指标都起到相应的作用,弥补了指标偏好DEA模型在评价过程中的缺陷,使得结果更具说服力。将实例的计算结果与指标偏好DEA模型评价得到的数据进行对比分析,从而验证了基于阿基米德无穷小量指标偏好DEA的合理性。最后,利用本文研究结果进行了实证研究。分别将指标偏好OC~2R模型和基于阿基米德无穷小量的OC~2R模型应用于高校综合绩效评价问题中,得到相应的评价结果。通过与C~2R模型评价结果的对比分析,从而验证了本文研究结果的合理性和实用性。