新型农村合作医疗制度是关乎我国农业人口健康状况的重要事业,是建立社会主义新农村的重要内容。自2003年在全国启动以来,新农合制度通过将近10年的发展取得了长足的进步,并初步解决了农民“因病致贫、因病返贫”的问题。　　由于新农合的经营特点与商业保险公司业务十分相似,对于引入商业保险公司运营新农合基金的讨论早已有之,并且,某些地域在新农合启动之初就采用饿了与保险公司合作的形式。这一现象的产生,不仅是由于政府有着转变职能的动机,更是由于商业保险公司专业化的风险管理理念、管理手段和运营模式为提高新农合运营效率提供了可能。近年来,这种合作模式经过不断地演变,逐渐的发展出了基金管理模式、风险管理模式以及混合模式三种。　　本文首先对近年来新农合发展以及商业保险参与新农合运行的发展进行了阐述,并对目前的研究现状进行了回顾。随后,分商业保险公司和政府两个角度对商业保险参与新农合运行的必要性进行了分析。从商业保险机构的角度看,主要包括建立良好政企关系的动机、市场竞争的推动、拓展市场的捷径;从政府的角度看,主要包括降低新农合运行成本的需要、对人员数量及其素质的担忧、政府加速职能转变的大环境。　　在对商业保险参与新农合运行的必要性进行分析之后,本文对实现合作的各种模式进行了简要的分析。随后,本文通过对河南省宜阳县、汝阳县和江苏省江阴市、泰州市高港区2009年至2012年新农合运行数据的比较分析,对政府统办、委托管理、风险管理三种模式,在人力成本、经费支出效率、补偿程度及结构、次均费用四方面的差异进行了比较分析。通过总结比较分析的结果,本文提出了最终的结论以及相关的政策建议。