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半滑舌鳎(Cynoglossussemilaevis)是我国北方珍贵的鱼种,也是鱼类中研究性别决定机制理想的模式生物。本研究利用全基因组测序方法筛选出微卫星标记,以渤海近海野生个体和人工养殖的半滑舌鳎为亲本交配产生的F1代全同胞家系为作图群体,构建了半滑舌鳎雌、雄和微卫星标记遗传连锁图谱。研究主要结果如下:
1.多态性标记的开发
从本实验室全基因测序的结果中挑选出具有微卫星标记的序列,设计并合成SSR标记2000对,最终获得出800多对多态性好的SSR引物。为半滑舌鳎分子标记辅助育种、遗传连锁图谱的构建提供足够的标记。
2.遗传连锁图谱的构建
用筛选出来的800个具有多态性的SSR对父母本和92个F1代个体进行遗传分析,构建半滑舌鳎遗传连锁图谱。图谱共定位495个分离标记,其中包含15个性别特异标记和134个偏分离标记(P<0.05)。
雌性图谱定位437个微卫星标记和15个性别特异标记,分布在21个连锁群中,连锁群的标记数目从11~47不等,连锁群长度在33.6~146.4之间,图谱的预期长度Ge为1825.2cM,标记间平均间隔(s)为4.1cM,图谱覆盖率为96.4%。
雄性图谱定位452个标记,分布于21个连锁群中,连锁群的标记数目从7~43个不等,连锁群长度在35.1cM~146.0cM之间,图谱的预期长度Ge为1731.3cM,标记间平均间隔(s)为4.1cM,图谱覆盖率为89.9%。半滑舌鳎遗传连锁图谱的构建为其重要经济性状QTL定位、分子标记辅助育种和性别控制奠定了重要基础。