绵羊繁殖候选基因的组织表达、SNP及其与产羔数的关联分析

来源 :河南科技大学 | 被引量 : 4次 | 上传用户:a395744775
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产羔数是衡量绵羊繁殖性能的主要指标,是一个极其复杂的性状,受遗传背景、营养水平、饲养管理等因素影响。绵羊排卵数是最重要的因素之一,而卵泡发育及排卵是极其复杂的一个过程,需要来自下丘脑-垂体-卵巢轴的内分泌激素的联合调控。根据前人的研究结果可知,ESR1、ESR2、PGR、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1、SMAD1、BMP15、HSD3B1基因不同程度的参与卵巢类固醇激素的合成、吸收和释放,在卵泡的生长发育和排卵过程中发挥着重要作用。因此,本研究以这9个基因为研究对象,采用RT-PCR和Real-time PCR技术检测其在苏尼特羊和小尾寒羊FecB基因野生型单羔群体和多羔群体下丘脑-垂体-卵巢轴等组织的表达特征,使用MassARRAY飞行时间质谱技术结合生物信息学分析方法研究上述基因在不同绵羊群体的SNP位点多态性及其与小尾寒羊产羔数的关联性,为绵羊遗传育种研究提供新的分子标记。主要研究结果如下:1、RT-PCR结果显示:ESR1和PGR主要在输卵管、子宫、卵巢表达;ESR2则主要在子宫高表达;BMP15在卵巢组织特异性表达;类固醇生成激素相关基因(HSD3B1、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1)大多数在卵巢中表达;SMAD1基因则为全身性表达。实时荧光定量PCR结果证明:ESR1、ESR2、PGR、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1、SMAD1、BMP15、HSD3B1基因主要在小尾寒羊和苏尼特羊下丘脑-垂体-卵巢组织表达,提示以上基因与卵巢功能密切相关。其中,ESR2、PGR、SMAD1、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1基因在小尾寒羊单、多羔绵羊品种内存在差异表达;ESR1、ESR2、PGR、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1、SMAD1、BMP15基因在小尾寒羊和苏尼特羊两个品种间存在表达差异,暗示ESR2、PGR、SMAD1、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1基因可能参与小尾寒羊FecB基因繁殖调控机制,结果值得进一步研究。2、利用生物信息学分析,发现小尾寒羊BMP15基因g.50971423T>C位点为错义突变,导致第252位氨基酸由亮氨酸突变为脯氨酸。ESR2基因g.73324006C>T位点为错义突变,导致498位氨基酸由精氨酸突变为组氨酸;HSD3B1基因g.96092576G>A为错义突变,导致第2位丙氨酸突变为苏氨酸;ESR1基因g.75378892A>T为错义突变,导致第36位异亮氨酸突变为苯丙氨酸;CYP11A1基因g.33217408C>T为错义突变,导致第41位丝氨酸突变为苯丙氨酸。PGR基因g.7491179C>T、CYP11A1基因g.33222725A>G位点为同义突变,CYP19A1基因g.56122588G>A位点为5’UTR变异,SMAD1基因g.12485895A>G、g.12487190G>T、g.12487467A>G、g.12487558G>A位点均为内含子变异均未直接引起氨基酸的变化。3、群体遗传学分析显示:参与分型的SNPs在多数绵羊群体表现为中度多态(0.25<PIC<0.5)和Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。产羔数关联分析表明:BMP15基因g.50971423T>C位点、HSD3B1基因g.96092576G>A位点、PGR基因g.7491179C>T位点、ESR1基因g.75521224T>A位点和CYP19A1基因g.56122588G>A位点不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间并无显著关联(P>0.05)。ESR1基因g.75378892A>T位点多态性与小尾寒羊不同胎次产羔数之间显著关联,AA型母羊产羔数显著高于TT型母羊(P<0.05)。ESR2基因g.73324006C>T位点多态性与小尾寒羊前三胎产羔数显著关联,CC型各胎产羔数均高于TC型(P<0.05)。CYP11A1基因g.33222725A>G、g.33217408C>T位点多态性与小尾寒羊前三胎产羔数均显著相关,AA型母羊产羔数显著高于AG型母羊(P<0.05);CT型母羊产羔数显著高于CC型母羊(P<0.05)。SMAD1基因g.12487190G>T位点多态性与小尾寒羊前三胎产羔数均显著相关,TT型母羊产羔数显著高于GT、GG型母羊(P<0.05)。综上所述,本研究以小尾寒羊FecB基因野生型中单羔、多羔群体及苏尼特羊为研究对象,初步研究了ESR1、ESR2、PGR、CYP11A1、CYP17A1、CYP19A1、SMAD1、BMP15和HSD3B1基因在小尾寒羊FecB基因野生型绵羊群体中的单羔和多羔和苏尼特羊中的表达情况,为进一步阐明FecB基因效应做基础。对上述基因SNPs进行批量分型,获得多个对产羔数有显著影响的新SNP位点信息,为绵羊遗传育种标记辅助选择提供新的素材。
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