中医学作为世界传统医学之突出代表，经过几千年的传承与发展，积累了丰富的医学信息资源。依托先进的信息技术，在浩如烟海的中医信息中通过工程处理实现知识发现、知识共享和自动推导，是中医学发展的方向之一。但中医理论深奥、概念抽象，经过漫长的历史演变，不可避免地存在概念表述的不统一、不规范问题，这使得应用中医信息变得相当困难。中医病机是中医理论的重要组成部分，是连接中医理论与临床应用的关键，本研究从病机入手，试图通过本体技术，探索中医信息标准化建设的思路和方法。　　 本研究阐述了本体的定义、分类、构建原则和构建方法，以及国内外医学本体的研究现状;同时介绍了上海中医药大学本体研究，特别对本体的语义关系研究做了重点介绍。结合术语组织与描述的两种方法即传统概念派方法和新词义派方法，本文改进了本体构建中语义关系的获取方法，并用此方法从国家标准《中医临床诊疗术语·疾病部分》病机描述部分中提取病机单元，以资源描述框架三元组的形式表述，从中获得语义关系，最终汇总成中医病机基本语义关系集合。本研究以《生物医学知识整合论》提出的物理学、生物学和认知逻辑学三大生物医学知识属性为基础，对中医病机语义进行深入解析、归纳和分类，形成中医病机语义关系的等级体系，并按本体语义关系属性特征对其进行描述。本研究引入“运算框架(ComputingFrame，CF)”的建构方法（由包含飞教授提出），突破了本体构建常用工具Protégé对语义关系的表述限制，解决了中医病机一元语义关系的本体表达的问题，从而构建了中医病机语义操作本体，实现了与中医顶层本体的整合。　　 最后，本研究以中医病机语义操作本体应用于中医信息的查询，表明该本体增强了语义查询和语义标注的功能。　　 本文探讨了中医病机语义操作本体从构建到应用的整个过程，并针对构建过程中出现的问题提出了解决的方法，对中医信息标准化研究具有一定的参考和借鉴意义。