近年来，由于科学技术的迅猛发展，技术创新及产业化的周期大大缩短，专业化分工和集成创新机制日趋完善，呈现出区域内创新要素集聚的特征。区域创新能力已经成为支撑地区经济增长，提高产业整体竞争力的基础性条件，成为全球化条件下决定区域参与国际产业分工地位的关键性因素。国家的竞争力在很大程度上取决于区域的竞争力，而区域的竞争优势则来源于区域内的创新产业集群，这已成为世界范围内政府与产业界的共识。产业集群不仅成为创造和保持区域竞争优势的有效方式，而且也成为国家参与全球产业分工的主要载体。　　 本文结合区域创新系统理论研究和产业集群理论，以区域创新系统以及创新产业集群价值流为主要研究线索，分析区域创新系统以及创新产业集群的组织体系，从而对区域创新系统以及创新产业集群中的各类实体的功能和创新规律进行系统分类和分析，提出区域创新系统以及创新产业集群发展的核心驱动因素，并借助于大量的实证数据，对有关理论和观点进行检验，从而更深刻的把握我国区域创新系统以及创新产业集群的发展规律，为理论研究和实践活动提供参考。　　 首先，主要分析了研究的背景和实践意义，总结了目前的研究进展和不足，并介绍了研究的思路和框架。　　 其次，分析了区域创新系统和产业集群的组织体系，通过整合区域创新系统理论研究和产业集群理论，分析现有研究提出的区域创新系统以及创新产业集群系统组织框架，总结区域创新系统视角下的创新产业集群的组织体系与功能，为更好地认识和把握创新产业集群的发展机理和规律提供理论支持；　　 第三，根据区域创新系统以及创新产业集群的组织模式分析，揭示区域创新系统以及创新产业集群发展的内部机制、传导过程和核心驱动因素，从理论上论证区域创新系统以及创新产业集群中的各类组织实体和环境因素对产业集群内企业的创新绩效的影响；提出了我国创新产业集群的驱动因素及其作用的系列观点，　　 第四，通过大量的实证数据，对有关理论和观点进行检验，各类组织实体和环境因素对产业集群内企业的创新绩效的影响，为理论研究和实践活动提供参考。　　 最后，对文章的研究成果进行了总结，并提出了相应的政策建议。　　 通过深入的分析，本文主要得出如下结论：　　 (1)区域创新系统中存在创新企业、政府、大学与研究机构、资金投资者以及中介机构等五个关键主体，形成核心、辅助支撑和外围支持三个不同层次的网络。创新产业集群则由创新企业以及与之关联的大学与研究机构、资金投资者以及中介机构等主体形成，是区域创新系统的组成部分。创新产业集群与区域创新环境的整合度越高，越利于产业和区域的发展。　　 (2)集群创新是一个复杂的过程，既要有一个适当的组织模式将创新目标和动力发挥出最高的集体效率，同时又通过多渠道的传导机制充分利用其内部动力机制，从而保证内部资源的最大程度利用。这一集群系统与区域创新系统紧密联系，要充分利用区域创新系统的资源、设施、制度和文化等软硬件环境，并通过良好的反馈机制，与区域良性互动，一方面实现自身的创新目标，一方面带动区域创新资源的进一步发展优化。　　 (3)区域创新系统中的组织实体和环境因素对创新网络的发展具有显著性影响。实证结果表明，有力的资金支持和创新文化导致了创新产业集群的良好增长；政府支持不能驱动创新产业集群增长甚至阻碍了创新产业集群的增长；大学和研究机构与创新产业集群的增长没有显著关系，公司和大学的互动通常是比较低；现有的制度环境对创新产业集群的增长并不有益，更大的问题在于制度的执行，而不是制度的存在。