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本研究以肉鸡为对象,旨在研究日粮中添加地衣芽孢杆菌H2对坏死性肠炎肉鸡生长性能和肠道菌群的影响。选取240只1日龄健康科宝-500肉鸡,随机分为4组,每组5个重复,每个重复12只,分别为空白对照组(NC组),造模组(PC组),球虫鱼粉消除组(FC组)和地衣芽孢杆菌防治组(BL组)。试验共持续22天,BL组在整个试验过程中的日粮均添加0.1%活菌数为1.0×109CFU/mL的地衣芽孢杆菌H2全菌液。从14日龄起,除NC组继续饲喂日粮一外其余各组均饲喂日粮二,并于15日龄灌喂球虫(100万卵囊/mL,1.0mL/只)。18-20日龄,PC组和BL组肉鸡连续灌喂1.0 mL/只活菌数为2.2×108CFU/mL产气荚膜梭菌,其余各组肉鸡灌喂相同剂量的生理盐水。结果表明:1.地衣芽孢杆菌H2的添加能显著提高14日龄健康肉鸡的体增重(P<0.05),22日龄时,坏死性肠炎的发生会显著降低肉鸡体增重并显著升高肉鸡料重比(P<0.05),地衣芽孢杆菌H2的添加能提高坏死性肠炎肉鸡的生长性能。2.PCR-DGGE检测22日龄肉鸡回肠和盲肠内容物菌群,发现聚类分析和主成分(PCA)分析结果相一致,各组肉鸡的回肠样品主要聚为两簇,BL组和NC组主要聚为一簇,PC组和FC组聚为一簇,其中PC组与NC组的最高相似性为0.70最低为0.64。各组盲肠样品主要聚为两簇,其中PC组样品单独聚为一簇,其余组样品聚为另一簇。PC组与NC组的最高相似性仅有0.68,BL组与NC组的相似性在0.68与0.83之间,BL组样品与空白对照组样品条带较PC组样品更为相似,PC组条带数量和位置与其他组不同,即菌群组成和结构与其他组有较大差异。3.实时荧光定量PCR检测22日龄肉鸡回肠和盲肠内容物菌群,发现乳杆菌和肠杆菌等为肉鸡回肠样品中的优势菌群,其数量均达到了109CFU/g以上。各组在总细菌数量上无显著差异(P>0.05)。与NC组相比,PC组乳杆菌属数量显著下降(P<0.05),BL组乳杆菌属数量与PC组相比显著上升(P<0.05)且与NC组无显著差异。与NC组相比,PC组中肠杆菌、梭菌类群Ⅳ、梭菌类群XIVa和拟杆菌门含量显著升高(P<0.05),BL组中以上菌群含量下降且与NC组无显著差异(P>0.05)。梭菌类群IV、梭菌类群XIVa等为肉鸡盲肠样品中的优势菌群,其数量均达到了1011CFU/g以上。与NC组相比,PC组在肠球菌的数量上无显著差异,在总菌、肠杆菌、双歧杆菌属和梭菌类群XIVa的含量上显著下降(P<0.05)。与PC组相比,BL组在总菌、肠杆菌和梭菌类群XIVa的含量上显著上升(P<0.05)且与NC组无显著差异。与NC组相比,PC组中梭菌类群Ⅳ含量显著下降(P<0.05),且该菌在BL和FC组中的含量与NC组无显著差异(P>0.05)。4.Illumina MiSeq检测发现,在回肠样品中,本试验共获得591010条序列,平均每个样品序列数为24625条,获得4854个物种分类的OTUs(Operational Taxonomic Units),平均每个样品OTUs为202个。在盲肠样品中,本试验共获得538091条序列,平均每个样品序列数为22420条,共获得11091个OTUs,平均每个样品的OTUs为462个。在alpha多样性指数中,回肠样品赵氏指数的范围为156.25-446.05,物种观察指数范围为96.00-305.30,香农指数范围为2.25-4.97,辛普森指数范围为0.62~0.93。盲肠样品赵氏指数范围为163.08-757.31,物种观察指数范围为144.10-546.60,香农指数范围为4.12~6.50,辛普森指数范围为0.82~0.98。与回肠样品相比,盲肠样品的微生物群落多样性高于回肠。且两个部位的变化表明,坏死性肠炎导致的肠道菌群变化在肠段不同部位有所不同。肉鸡回肠和盲肠微生物菌群OTU相对丰度的分析表明,在盲肠门水平微生物菌群中,PC组肉鸡拟杆菌门的百分含量比NC组肉鸡减少且差异显著(P<0.05),饲喂地衣芽孢杆菌H2的BL组能提高拟杆菌门的含量,且与NC组无显著差异(P>0.05),其余门水平微生物群落在各组无显著差异。在属水平的优势菌群中,回肠样品的紫单胞菌属和链球菌属的百分比数量在组与组之间有显著差异。其中PC组紫单胞菌属的数量显著高于NC组,而链球菌属的数量显著低于NC组(P<0.05),在BL组或FC组中,这些菌群的百分比数趋于正常,且与NC组无显著差异(P>0.05)。在盲肠样品中,与NC组相比,PC组拟杆菌属和Faecalibacterium菌属的百分比含量上显著降低,在乳杆菌属和Dorea菌属上显著升高(P<0.05),而在BL组或FC组中,这些菌群的百分比数趋于正常,且与NC组无显著差异(P>0.05)。实验结果表明,坏死性肠炎的发生会显著影响肉鸡体增重和料重比,降低肉鸡的生长性能,地衣芽孢杆菌H2的添加能有效改善坏死性肠炎肉鸡的生长性能。坏死性肠炎能引起肉鸡肠道菌群的紊乱,在日粮中添加地衣芽孢杆菌H2能有效地调节由坏死性肠炎导致的菌群失调。