【摘 要】
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金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是温血动物体表和鼻腔常见的一种细菌,由于经常引发临床感染和食源性疾病,在多年的热点研究过程中,积累了大量的关于多样性的公开
【机 构】
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中美食品安全联合研究中心 陆伯勋食品安全研究中心 上海交通大学农业与生物学院微生物代谢国家重点实验室 上海200240
【出 处】
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中国食品科学技术学会第十二届年会暨第八届中美食品业高层论坛
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金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是温血动物体表和鼻腔常见的一种细菌,由于经常引发临床感染和食源性疾病,在多年的热点研究过程中,积累了大量的关于多样性的公开数据.我们发现由金葡菌整个MLST数据库构建的聚类树上存在两个分歧明显的小分支,并尝试用基因型相干性(genotype coherence)的理论来解析分支间的关系.首先用划分可操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs)的方法分析MLST(multilocus sequence typing)数据,接着据此筛选了67个相关的基因组数据进行泛基因组分析.结果显示：一个分支是因为7个基因位点有1-2个因水平基因转移(horizontal gene transfer,HGT)引入了其它葡萄球菌的基因；另一个分支包含最新建立的两个葡萄球菌物种银色葡萄球菌(S.argenteus)和施维策葡萄球菌(S.schweitzeri),这三个物种停留在一个很低的分歧水平,它们的基因库之间有明显的重叠部分.另外,我们根据基因型相干性设计了一种新的检测HGT的方法来评价"金黄色葡萄球菌复合群"(Staphylococcus aureus complex)物种间的关系.基于整个研究结果,我们认为金黄色葡萄球菌复合群正处在物种形成过程中,这势必会引发更多的关于"金葡菌"多样性和进化的研究.
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