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对国内分离的9株水貂肠炎细小病毒结构蛋白vp2基因进行扩增，获得了全长1755bp的基因序列，其编码584个氨基酸；应用DNAStar分析软件对9株MEV与7株MEV参考毒株的核苷酸和氨基酸进行同源性分析表明，不同时间和地域分离毒株VP2基因核苷酸同源性为98.7％～99.9％，氨基酸同源性为97.4％～99.7％，说明国内外分离的MEV的vp2基因遗传变异率较低；系统发生树分析表明国内分离的8株MEV(包括疫苗株)属于同一个组群；16株MEV氨基酸进化分析表明，MEV第80、93、103、323、564、568位的6个关键氨基酸相对保守，并发现国内外分离株在第300位氨基酸存在差异。