黄河入海口沉积物中氨氧化细菌及氨氧化古菌的丰度及多样性研究

来源 :华东六省一市生物化学与分子生物学会2015年学术交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pretter
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微生物介导的氨氧化过程在全球氮循环中起着至关重要的作用.该过程主要由氨氧化细菌(AOB)及氨氧化古菌(AOA)两类菌群主导.虽然此前很多研究报到了不同生境中中氨氧化微生物的群落组成及丰度情况,但是关于入海口环境中氨氧化微生物的群落结构与丰度对环境因子的响应变化研究鲜有报道.本研究以人类活动频繁,碳氮污染严重的黄河入海口为切入点,采集入海口附近沉积物样品,针对氨氧化微生物特有的氨单加氧酶(amoA)基因,利用荧光定量PCR (qPCR)及克隆文库的方法对样品中AOA及AOB的丰度群落及结构多样性进行检测.qPCR结果显示,黄河入海口环境中AOA丰度高于AOB,其中,AOA的amoA基因拷贝数范围从6.53±0.67×104to1.06±0.11×106copies g-1,AOB的的amoA基因拷贝数范围从1.61±0.28×104到6.07±0.18×105copies g-1.皮尔森相关性研究显示,AOA的amoA基因丰度与氨氮,总碳和总有机碳显著相关(p<0.05),而AOB的amoA基因丰度只与氨氮显著相关(p<0.05).系统发育研究显示,在AOA可以分为三个cluster,其中Nitrososphaera cluster最为优势,占到AOA全部序列的64.98%;与此同时,AOB可以分为五个cluster,其中Nitrosospira和Nitrosomonas是有优势类群,分别可以占到AOB全部序列数的66.40%与33.60%.α多样性分析显示,AOB较AOA而言有更高的多样性,推测可能与入海口地区沉积物pH值偏碱有关.结合环境因子的冗余分析(RDA)表明,AOA的群落结构类群与总碳显著相关(p<0.05),而对AOB而言,总碳是对其群落结构有最大影响的环境因子.本研究有力的证实了氨氧化微生物在黄河入海口的存在,增加了对温带河口环境中氨氧化微生物分布及其影响因子的认识.
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