药材甲(Stegobium paniceum)转录组研究

来源 :中国植物保护学会2014年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dingmx2008
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  药材甲[ Stegobium paniceum(Linnaeus)],属鞘翅目(Coleoptera)窃蠹科( Anobiidae),该虫是世界性分布的储藏物害虫,食性复杂,严重为害储藏物食品、药材、储藏药草、图书档案等.对药材甲研究一直围绕害虫发生为害、种群控制和生理生化水平的气调毒理学展开,然而,分子生物学信息的缺失已经成为阻碍研究继续深入的一大问题.高通量测序技术的广泛应用为药材甲分子生物学研究提供了便利.基于此,使用nlu-mma技术在转录组水平上对药材甲分子生物学信息进行解析,可有效获得其与解毒代谢、杀虫剂靶标酶等相关的基因信息,为后续研究T作开展奠定了基础.通过对测序结果的组装、拼接及分析,获得了95 717条Contig和39 270条umgene,将获得的unlgene提交NC-BI数据库比对,共有29 274条与数据库中的已知蛋白相匹配,有74.3%的umgene和赤拟谷盗(Tribolium ca.staneum)的基因相似度最高.根据Clusters of Orthologous Groups( COG)、Gene Orthology(GO)以及Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)注释,对unlgene的功能分类和代谢通路进行了预测分析.从药材甲转录组数据中筛选鉴定出多条与解毒代谢酶和杀虫剂靶标酶相关的umgene,包括81条P450,34条GST,13条CarE、8条AChE、9条nAChR以及鱼尼丁受体等基因的cDNA序列,其中,大量基因具有完整开放阅读框.以赤拟谷盗、黑腹果蝇等物种的基因序列为参考,利用MEGA软件构建系统发育树进行聚类分析,结果发现,所获得的序列涵盖了各类基因的多个家族和亚家族.在此基础上,针对不同解毒代谢酶和靶标酶基因的作用特点,综合运用RNAi、异源表达等技术开展药材甲抗药性的相关研究,明确杀虫剂与代谢以及靶标之间的相互关系,为今后更好地引导杀虫剂研发和治理抗性提供理论依据.本研究提供了药材甲大量翔实的基因信息,为从分子生物学角度研究药材甲解毒代谢酶和靶标酶基因的功能奠定了坚实的基础.
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