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市场经济条件下，发展生态农业的目的，是以向社会提供优质生态农产品的前提下，生态农产品生产者获得比非生态农产品生产者更多回报，以及使农业得到可持续发展。基于此，发展生态农业必须挖掘本地的比较优势，建立在比较优势基础上的发展才可能是有潜力和可持续的。另外，发展生态农业必须进行土地改良、设备设施投入、科技投入与市场开拓投入等多方面的投入。这些投入，单纯依靠不具备规模经济效应的小面积耕作农户的自身投入是不可能的，所以，政府的引导与财政支持是推动生态农业发展的关键。