葡萄AGAMOUS-like MADS-box基因的克隆与表达特性研究

来源 :第二届全国果树分子生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:amuro111
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根据获得的MADS-box基因片段设计一条特异引物,通过3RACE方法获得了全长cDNA,命名为VvAG(GenBank登录号:EF209334)。该片段全长978bp,包含一个681 bp的开放阅读框,编码226个氨基酸残基。通过设计特异引物RT-PCR扩增得到了编码区全长cDNA。推导的氨基酸序列与拟南芥的AGAMOUS类MADS-box基因AG、SHPI/SHP2均有较高的同源性(同源性分别为770.9%、710.2%、690.9%)。系统发育分析将VvAG基因归入MADS-box基囚家族AG亚家族的euAG进化系。半定晕RT-PCR分析显示,该基因在葡萄的叶片、卷须、休眠芽、花序、果实中均表达,并且在花器官的萼片、花瓣、雄蕊、雌蕊中也均检测到VvAG的表达,而且在这些组织中的表达丰度均较高。通过将VvAG与一个葡萄shotgun基因组序列(AM478968)比对发现其基因组从起始密码子到终止密码子全长7534 bp,由7个外显子和6个内含子组成。
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