新型鸭细小病毒全基因组克隆

来源 :福建省科协第十六届学术年会畜牧兽医分会场——福建省畜牧兽医学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ltsomeday
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近年来,水禽细小病毒的呈现非典型感染和致病型感染差异的新变化,本研究从雏番鸭中分离到一株水禽细小病毒(FJM3株),并对其进行全基因组克隆.结果表明,FJM3株基因组全长为5017nt,其基因组结构和经典番鸭细小病毒参考毒株一致.序列比对结果表明,FJM3株全基因组序列与GenBank中登录的经典MDPV参考株(FM株)核苷酸序列同源性为94.0%,与番鸭源GPV参考株(Y株)核苷酸序列同源性为85.6%.全基因组遗传进化分析表明,FJM3株处于MDPV遗传进化分支;VP1基因遗传分析表明,FJM3株处于经典MDPV遗传进化分支;VP3遗传进化表明,FJM3株处于GPV遗传进化分支.对FJM3株和参考株(FM株、Y株和SYG61v)进行遗传重组分析表明,该毒株于存在两处MDPV与GPV的基因重组现象.本研究发现,在当前流行一个水禽细小病毒新种(Species)——新型鸭细小病毒.
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