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以我国重要的淡水鲤科鱼类草鱼(草食性)和翘嘴鲌(肉食性)为对象,应用RACE、Real-time PCR和酶活性测定等技术方法,对其胰蛋白酶原的基因克隆、早期表达和胰蛋白酶活性进行了比较研究。结果表明：(1)草鱼和翘嘴鲌胰蛋白酶原eDNA全长分别为869 bp和857 bp,其推导的氨基酸序列全长分别242 aa和247aa,氨基酸序列全长均包含维持丝氨酸蛋白酶催化活性和构象所需的保守区域,说明胰蛋白酶原基因克隆的正确性；等电点和进化树分析表明,草鱼和翘嘴鲌胰蛋白酶原基因分别属于硬骨鱼类第一类和第二类胰蛋白酶原基因；(2)两种鱼类胰蛋白酶原mRNA均在孵后2d得到检测,并在孵后第11天和第23天出现峰值,从而表现出相似的早期表达模式；(3)两种鱼类其胰蛋白酶比活性均在孵后第2天得到检测,此时草鱼和翘嘴鲌仔鱼均尚未开口。