基于16SrRNA部分序列探讨中国近海十三种石首鱼类的分子系统进化关系

来源 :2009年中国水产学会学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:boylsc
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  为进一步探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增获得了石首鱼科9属13个种的线粒体1 6 S rRNA基因片段序列,纯化后直接测序,以大斑石鲈(Pomadasys maculatus)为外群,利用MEGA4.1,DnaSpv5软件对序列变异和碱基组成进行分析,计算遗传距离,平均核苷酸变异度数等遗传信息指数,并结合GENEBANK上浅色黄姑鱼(Nibea coibor)和云纹犬牙石首鱼(Cynoscion nebulosus)构建系统树.根据所得分子生物学数据并结合已知形态学理论,得出如下结果:1)叫姑鱼亚科是最早独立分化出来的一支;银牙(鱼或)(Otolithes argenteus)是继叫姑鱼亚科后较早分化的一支;黄鱼亚科为最后分化并成为石首鱼类中最繁盛的一个亚科;勒氏石首鱼(石首鱼亚科)除了与大黄鱼小黄鱼遗传距离很远(0.170,0.172)外,与其它亚科的种遗传距离集中在0.128到0.164.这支持形态学上将其作为系统树根部的处理;2)银姑鱼(Pennahia argentatus)与分子树最上端的黄鱼亚科聚在一起,并且处在该大支的最下端,且银姑鱼与小黄鱼大黄鱼 鮸鱼棘头梅童鱼之间的遗传距离分别为0.099,0.106,0.0900.090;说明银姑鱼是白姑鱼亚科分化最晚的一种;而白姑鱼亚科的其它种属位置比较游离,需要进一步考证;.3)牙(鱼或)亚科的银牙(鱼或)是属继叫姑鱼之后较早分化的一个种,但是尖头黄鳍牙(鱼或)不与银牙(鱼或)聚类,需要别的基因进行进一步考证.
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