笔者在中国科学院杨焕明教授的启发和帮助下，开始了抗肿瘤中药的基因表达谱研究，选择具有确切临床疗效，基础研究扎实的中药制剂，抗肿瘤中药—康莱特和扶正中药—参附注射液，以基因芯片技术研究中药抗肿瘤的基因表达和功能调控。 笔者的工作分两个阶段，第一阶段2000年在国家中医药管理局申请到立项不资助课题：“康莱特抗小鼠肺腺癌恶病质中药反应性基因研究”(项目批准号：2000-J-B-25)。建立小鼠肺腺癌恶病质动物模型，用康莱特注射液为治疗组，参附注射液和甲孕酮做对照组，干预后取小鼠全血和组织细胞，分别提取mRNA，与空白对照组的mRNA点在2048点小鼠cDNA芯片上杂交，对所得差异表达基因运用生物信息学手段分析，找到差异表达基因。在取得初步结果后，第二阶段在2001年又获得国家自然科学基金资助：“薏苡仁脂抗肿瘤转移反应性基因研究”(项目批准号：30070957)，在小鼠4096个cDNA芯片上重复第一阶段实验，将3次实验都表达的差异表达基因和肿瘤相关基因，免疫相关基因，定制含150条50-mer基因的康莱特中药反应性相关基因寡核苷酸围栏芯片，整理出康莱特3张芯片相同差异表达基因，试图探讨康莱特注射液可能的疗效机理。