贵州瓮安陡山沱组磷矿层含有最古老的多细胞动物化石、多细胞藻类、大型带刺疑源类、可能的动物骨骼化石及蓝藻等,磷酸盐化微体化石也被发现.早期,生物遗体的简单堆积被解释为磷块岩的成因,随后,"上升洋流说"成为解释磷块岩成因的主要理论.磷块岩成因理论中诸如古地理特征、生物聚磷、物理改造再富集等要素也被逐渐接受.磷块岩作为一种微生物岩,从生物有机成矿的角度对其进行成因研究仍然是一种重要途径.瓮安磷块岩的形成与生物作用之间有一定的联系.瓮安磷块岩呈中稀土略显富集的向下凹的较开阔的帽状形态，不同层位的磷块岩具有较为相似的稀土配分模式，曲线较平缓，呈Ce负异常，这种典型的帽状稀土配分型式被认为是由于生物或有机质参与磷块岩形成作用的结果。古生代以来的牙形石、鱼骨堆积成因的磷灰石的稀土元素配分模式也具有类似的配分模式形态，这可能是由海水中细菌等微生物控制生成的特有的磷灰石稀土元素配分模式，体现了生物在磷块岩形成中的作用。