西吡氯铵是一种阳离子季铵类化合物，它很容易吸附到口腔黏膜及牙齿表面，其带有正电荷的亲水结构区可以和外表面带有负电荷的细菌结合并发生反应，并破坏细菌细胞膜结构完整性并导致胞质成分的渗漏，从而干扰细菌的代谢和生长.过去的几十年，有许多关于西吡氯铵漱口水在治疗牙龈炎及抗菌斑方面的临床随机对照研究和少量系统评价已经发表，这些临床随机对照试验和系统评价明确表明西吡氯铵在抗菌斑及抗牙龈炎方面有一定的作用.有关西吡氯铵在减少牙科诊室内感染性气溶胶的临床研究较少，其中一篇随机对照研究表明0.05％西吡氯铵漱口水可以有效减少超声波洁牙过程中扩散到空气中的微生物含量，其效果和氯己定漱口水组相当，因此牙科操作前常规使用西吡氯铵漱口水可以预防病人及诊室工作人员的的院内感染.术前口腔局部使用西吡氯铵抗菌剂可以降低牙科术后菌血症的发生率，这对于心血管瓣膜受损、极度衰竭的病人可以起到很重要的保护作用.0.05％的西吡氯铵漱口水在中长期的时间内(6周)不会改变口腔正常菌群的数目，更长时间的使用西吡氯铵漱口水是否会造成口腔菌群失调还不确定.西吡氯铵漱口水可以导致的副作用主要有牙面的着色、口腔黏膜溃疡和灼口症，但是西吡氯铵引起的口腔表面着色没有氯己定严重.基于以上西吡氯铵在口腔临床中的应用及其特点，其可以被当作口腔局部抗菌剂的一种选择.