草鱼呼肠孤病毒新分离株基因组片段S1、S2的全长克隆与序列分析

来源 :中国水产学会鱼病专业委员会第七次会员代表大会暨学术讨论会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ny341
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  我们于2008年9月从浙江湖州分离到一株草鱼呼肠孤病毒(GCRV),定名为HZ08,对其基因组片段S1和S2进行了全长克隆和序列分析.S1片段长3927bp,编码一个分子量约为143.6 kDa的蛋白.S2片段长3822bp,编码一个分子量约为143.1 kDa的蛋白.S1、S2都具有相同的5端和3端保守序列:5GUAAUUU......UUCAUC 3,邻近末端保守碱基的序列具有不完全反向重复特征.序列分析表明S1编码的蛋白具有鸟苷酸基转移酶和甲基转移酶的功能.S2编码RNA依赖性RNA聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp).利用RdRp的构建系统进化树,结合病毒的理化特性和生物学特性,初步认定HZ08是水生呼肠孤病毒属的一个新成员.
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