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为研究基于ITS2序列对牛膝及其混伪品鉴定的新方法,利用实验室改良的试剂盒法提取不同居群的牛膝和川牛膝共31份药材的基因组DNA,PCR扩增ITS2的基因序列并进行双向测序,CodonCode Aligner拼接序列,MEGA5.0软件分析川牛膝、牛膝及其混伪品牛蒡根种内、种间K-2-P距离,构建邻接(NJ)树,预测ITS2二级结构。结果表明:不同居群的川牛膝或牛膝种内 ITS2序列无差异,但川牛膝和牛膝及其混伪品的种间变异较大,利用NJ树可以明显区分川牛膝、牛膝及其混伪品。ITS2条形码序列能够成功鉴定川牛膝、牛膝及其混伪品,可作为分子鉴定的新途径。