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肠道微生物已经成为宿主的一个有机组成部分，其能够影响宿主肠道的结构与功能、先天性和获得性免疫系统，并参加宿主的物质和能量代谢.因而，肠道微生物受到了越来越多的重视.草鱼(Ctenopharyngodon idellus)是世界第一大淡水养殖鱼类，也是我国淡水养殖第一品种，约占我国淡水养殖鱼类总产量的21.4％.