基于转录组测序的Okadaic acid生物合成相关基因的挖掘

来源 :第十届全国海洋生物技术与创新药物暨海洋生化学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhengyicai2010
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  目的:研究不同营养条件下利玛原甲藻的转录组信息,同时对腹泻性贝毒软海绵酸(Okadaic acid,OA)的生物合成相关基因进行初步解析.方法:本研究选取了初始氮浓度:磷浓度分别为15∶1 和30∶1 的培养条件培养利玛原甲藻P.lima,2 种营养条件下培养5、10、20、30、40 天,收集藻细胞进行Illumina Hiseq 2000 测序,利用Trinity 进行de novo 拼接,得到的转录本通过Nr 数据库、UniProtKB/Swiss-Prot 数据库、COG 数据库进行功能注释及分类,通过KEGG 数据库进行相关代谢途径注释.
其他文献
  目的:制备羧甲基壳聚糖复合材料,研究其在放射性废水处理中的应用。引言:壳聚糖来源于甲壳类动物的壳,是甲壳素脱乙酰基的产物,由于具有大量的游离的氨基和羟基,使其具备良好的
  探索一种简便快捷的鉴别儿茶酚类化合物(如多巴和多巴胺)保护基类型的分析方法,促进含多巴抗帕金森病寡肽和医用仿生黏合剂的合成与研究.方法:(1)TLC 板上的显色反应:在GF25
  目的:研究罗非鱼皮酶溶性胶原蛋白(Pepsin soluble collagen peptide from Tilapia skin,PSCPT)、罗非鱼皮酸溶性胶原蛋白(Acid soluble collagen peptide from Tilapia s
  目的:研究水蛭肽Hirulog-s 对单链尿激酶型纤溶酶原激活剂和纤溶酶原相互活化作用的影响来考察新型合成水蛭肽的纤溶作用特性。方法:构筑单链尿激酶型纤溶酶原激活剂(pro-u
  目的:研究溶液配比、纺丝参数对蓝鲨鱼皮胶原/壳聚糖/聚氧化乙烯复合超细纤维膜静电可纺性的影响;在聚氧化乙烯含量不变的情况下,讨论不同质量配比胶原和壳聚糖对大鼠口腔溃
  烟碱型乙酰胆碱受体(nicotinic acetylcholine receptors,nAChRs)是一类介导众多中枢神经系统生理功能的配体门控离子通道受体,它们可以被乙酰胆碱、胆碱和尼古丁等激活
  目的:研究滑石粉对海洋共生弯孢霉菌体形态及活性化合物Curvulamine 合成的影响.方法:(1)滑石粉共培养方法:滑石粉(Talc powder)用柠檬酸二钠和柠檬酸配制成pH 为6.5 的缓冲
  随着水体富营养化的加剧,有毒蓝藻水华事件在国内外频繁发生。节球藻毒素(Nodularin)是一系列具有环状五肽结构的新型蓝藻毒素,主要由海水中的泡沫节球藻(Nodularia spumig
会议
  植物病害给农业生产造成了巨大的损失。尤其是植物真菌病害,仅对水稻、小麦和玉米的危害,每年 给全球农业带来约600 亿美元的经济损失。另一方面化学农药的长期大面积的滥