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从病理学和从生物学角度看肝癌有明显不同:诊断的重点前者重形态，后者重生物学特性(侵袭性、转移潜能和转移靶向等)；治疗目标前者在于消灭肿瘤，后者则旨在改变癌侵袭性、降低转移潜能；应用手段前者有手术、放疗、化疗和局部治疗等，后者则注重生物治疗(如分子靶向治疗、基因治疗、瘤苗、反义核酸、免疫治疗和分化诱导治疗等)；预后指标，前者重形态相关的生物学特性(如血管侵犯)；后者则为基因谱/蛋白谱相关的生物学特性(分子分型等)；疗效评价指标前者重肿瘤的有效率，后者重总生存率。
本文从四个方面论述：1.从生物学角度的肝癌诊断概念将发生重要变化。2.从“病理学基础”和“病理-生物学基础”研究肝癌治疗的异同。3.“病理学基础”的肝癌治疗进展。4.“病理-生物学基础”的治疗思考。