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1997-1998年我们对新疆主要棉区棉花黄萎病菌土壤含微菌核菌量和致病办分化初步研究结果表明，对石河子和玛纳斯棉田表土5～10cm棉花黄萎病3级病株根际混合土壤，分离镜检结果，棉花黄萎病田土壤含微菌核数量为100～200个/g土，微菌核大小为88.9～101.6μm×38.1～50.8μm。采用6个鉴别寄主，将供试10个棉花黄萎病菌菌系划分为3个致病型，强致病型菌株3株，主要为北疆菌系（玛纳斯、石河子），平均病指范围为57.1～69.1；中等致病型菌株4株，平均病指范围为29.8～37.2，弱致病型菌系3侏，平均病指范围为9.0～19.0，中、弱致病型菌系多为南疆菌系，喀什地区巴楚县棉花黄萎菌系例外，属强致病型，平均病指为60.1。