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基因组(Genome)是生物基本遗传信息的载体，由作为基本功能单位的基因序列和各种非编码基因的含遗传语言元素或结构功能的序列组成，是遗传的基本功能单位，是一个物理的载体。基因组学还可以做分子流行病学和微生物的进化研究，比如SARS的流行病学调查。目前来看基因组对病原生物学的作用主要体现在分子流行病、致病和毒性机制、感染敏感性、药物靶点、抗/耐药性和疫苗研发上。本文对基因组时代的病原生物学进行了研究。