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本文采用PCR-DGGE指纹图谱技术研究荣昌猪、长白、杜洛克猪肠道微生物群落的多样性，进行了不同品种间肠道微生物群落差异比较。通过提取猪粪样总DNA，进行16S rDNA的V3区扩增及DoGE电泳分析。结果表明，在DGGE图谱中，荣昌猪肠道微生物群落多样性最高，共34条较明显的种属菌条带，长白、杜洛克猪分别有31条、27条种属菌条带。其中有10个条带是三个品种猪共有的优势种属菌条带。荣昌猪与杜洛克猪的肠道微生物群落差异为37.3％;荣昌猪与长白猪的肠道微生物群落差异为31.8％。研究初步表明，相同生长环境中，猪肠道微生物群落差异可能与品种不同有关。