因为《药师琉璃光如来本愿功德经》的流传、宣扬和药王菩萨的“现世度厄”的功用，甚至出现了关于药王菩萨显现治疗民众疾病的疑伪经，如在《续藏经》卷87中收录的《佛说化珠保命真经》一卷，就可能是一部疑伪经。《佛说化珠保命真经》下题为“药王菩萨化理流布”，可知此经也是与药王佛有光。解读这部《佛说化珠保命真经》及其为此经所作的序，可以看到此经在中国思想史的发展中也发挥了一定的作用。有学者指出本经是一部疑伪经，从经中所使用的词语和内容来看，本经具有禅学色彩，所以疑其为伪经，也不是没有道理的。不过，本经却符合药王菩萨治疗疾病的主旨。从刑敬的序来看，《药王菩萨化珠保命真经》以及游僧对于贵阳痘患的治疗，颇有神异色彩。与王阳明引用佛教、禅学义理、公案典故相比，这篇《药王菩萨化珠保命真经序》不仅直接证实了王阳明与佛教之间的密切关系，而且可能它在王阳明心学思想的创立和发展中还发挥了重要的作用。